Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp5Q9Z2P8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms