Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd3Q9Z2D8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd3Q9Z2D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd3Q9Z2D8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms