Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z287

Krtap12-1, Keratin-associated protein 12-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap12-1Q9Z287 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap12-1Q9Z287 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Krtap12-1Q9Z287 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms