Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ap3b1Q9Z1T1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ap3b1Q9Z1T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms