Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna2d3Q9Z1L5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms