Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Padi1Q9Z185 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms