Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Padi3Q9Z184 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Padi3Q9Z184 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Padi3Q9Z184 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms