Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sema4fQ9Z123 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema4fQ9Z123 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms