Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Msl3Q9WVG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msl3Q9WVG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msl3Q9WVG9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms