Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme4Q9WV84 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme4Q9WV84 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme4Q9WV84 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nme4Q9WV84 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nme4Q9WV84 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms