Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mixl1Q9WUI0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms