Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms