Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SnurfQ9WU12 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SnurfQ9WU12 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms