Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sema6cQ9WTM3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema6cQ9WTM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms