Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psma4Q9R1P0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psma4Q9R1P0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psma4Q9R1P0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psma4Q9R1P0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma4Q9R1P0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma4Q9R1P0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms