Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trex2Q9R1A9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trex2Q9R1A9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms