Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mpdu1Q9R0Q9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms