Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prkab1Q9R078 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms