Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp11cQ9QZW0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp11cQ9QZW0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms