Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clcf1Q9QZM3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clcf1Q9QZM3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms