Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx4Q9QY61 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Irx4Q9QY61 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms