Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tcea2Q9QVN7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcea2Q9QVN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms