Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psma6Q9QUM9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms