Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cul3Q9JLV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cul3Q9JLV5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cul3Q9JLV5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms