Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Aldh9a1Q9JLJ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms