Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlr5Q9JLF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlr5Q9JLF7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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