Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chrac1Q9JKP8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chrac1Q9JKP8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chrac1Q9JKP8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms