Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx6Q9JKK1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx6Q9JKK1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms