Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl39Q9JKF7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl39Q9JKF7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.1 ms