Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap3m1Q9JKC8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap3m1Q9JKC8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms