Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Msgn1Q9JK54 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msgn1Q9JK54 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msgn1Q9JK54 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms