Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnmb4Q9JIN6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnmb4Q9JIN6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms