Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dap3Q9ER88 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dap3Q9ER88 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms