Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn1Q9EPL2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn1Q9EPL2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms