Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan4Q9DCK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms