Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fundc1Q9DB70 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fundc1Q9DB70 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fundc1Q9DB70 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms