Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Asf1bQ9DAP7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Asf1bQ9DAP7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms