Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9DA42 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9DA42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9DA42 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DA42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DA42 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9DA42 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9DA42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9DA42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9DA42 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms