Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8N1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8N1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8N1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms