Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slc52a2Q9D8F3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Slc52a2Q9D8F3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms