Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn23Q9D7D7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn23Q9D7D7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn23Q9D7D7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn23Q9D7D7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn23Q9D7D7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms