Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbe1Q9D6Y9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gbe1Q9D6Y9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gbe1Q9D6Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms