Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubb4aQ9D6F9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubb4aQ9D6F9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms