Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc7Q9D541 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc7Q9D541 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc7Q9D541 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms