Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc83Q9D4V3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc83Q9D4V3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms