Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms