Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gpn3Q9D3W4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpn3Q9D3W4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms