Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt20Q9D312 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt20Q9D312 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms