Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed11Q9D2R4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmed11Q9D2R4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmed11Q9D2R4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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