Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Batf3Q9D275 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Batf3Q9D275 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms